藥用塑料瓶最常用的滅菌方式是環氧乙烷滅菌，其設備是無菌醫用包裝生瓶產企業除萬級凈化車間外的另一個無菌處理設備。環氧乙烷本身是一種有毒氣體，可在常溫下殺滅各種微生物，包括芽孢、結核桿菌、細菌、病毒、真菌等。

藥用塑料瓶

環氧乙烷滅菌優點是：1、能殺滅所有微生物，包括細菌芽孢。 2 滅菌物品可以被包裹、整體封裝，可保持使用前呈無菌狀態。 3、相對而言，EO不腐蝕塑料、金屬和橡膠,不會使物品發生變黃變脆。 4、能穿透形態不規則物品并滅菌。5、可用于那些不能用消毒劑浸泡，干熱、壓力、蒸汽及其他化學氣體滅菌之物品的滅菌。

環氧乙烷（EO）為一種最簡單的環醚，屬于雜環類化合物，是重要的石化產品。環氧乙烷在低溫下為無色透明液體，在常溫下為無色帶有醚刺激性氣味的氣體，氣體 [2]  的蒸汽壓高，30℃時可達141kPa，這種高蒸汽壓決定了環氧乙烷熏蒸消毒時穿透力較強。

環氧乙烷滅菌被廣泛應用于藥用塑料瓶等其他醫用包裝滅菌，因其對金屬不腐蝕，無殘留氣味，可殺滅細菌（及其內孢子）、霉菌及真菌，因此可用于消毒一些不能耐受高溫消毒的物品以及材料的氣體殺菌劑。美國化學家Lloyd Hall在1938年取得以環氧乙烷消毒法保存香料的專利，該方法直到今天仍有人使用。環氧乙烷也被廣泛用于消毒醫療用品諸如繃帶、縫線及手術器具。